Ocho días más tarde, antes de disputar el partido por la cuarta ronda de la FA Cup contra el Wigan Athletic, Bobby Charlton le entregó a Rooney una Bota de Oro en reconocimiento por haber superado su récord. En esa misma temporada jugó un partido más en la FA Cup y otro en la Copa de la Liga, avanzando hasta la tercera y cuarta ronda respectivamente. El 7 de enero de 2017, anotó un gol contra el Reading en la tercera ronda de la FA Cup para igualar a Bobby Charlton como máximo goleador histórico del Manchester United. El 27 de septiembre, se convirtió en el tercer máximo goleador histórico de la Premier League después de anotar un gol en la victoria por 2:1 contra el West Ham United. El 22 de marzo, marcó dos goles contra el West Ham United, convirtiéndose en el tercer futbolista con más goles en la historia del club. El 29 de noviembre, marcó su primer triplete con el Everton en la victoria por 4:0 sobre el West Ham United; su tercer gol fue un tiro desde su propio campo -a más de 60 metros de la portería-, marcando cuando el guardameta Joe Hart abandonaba el área de penalti para despejar el balón.
Fue nombrado capitán y su debut se produjo el 2 de enero, inició como titular y dio la asistencia para el primer gol en la victoria por 2:1 contra el Barnsley. Fue nombrado capitán después de tres partidos por el entrenador Ben Olsen, con el consentimiento del antiguo capitán Steve Birnbaum. Zidane como capitán llevó a Francia a clasificar al Mundial. Sin embargo, ha sabido tener también cruces con las demás selecciones que han sabido proclamarse campeonas mundiales, teniendo en esos cruces casos curiosos, como el de haber definido dos mundiales (y habérselos ganado) a Italia, camiseta de francia 2022 o el de estar en desventaja frente al combinado de Francia. La 2021-22 fue la primera temporada completa al frente del equipo. El 15 de enero de 2021 se retiró de manera oficial tras ser nombrado entrenador del equipo. En las Eliminatorias para Rusia 2018, Brasil se enfrentó en la primera fecha a Chile el 8 de octubre en Santiago, partido en el cual perdieron por 0-2, siendo ésta la única derrota que cosechó el equipo en las eliminatorias al mundial ruso.
La final opuso dos de los equipos más exitosos en la historia de la competición: Alemania y Brasil. Brasil buscaba su cuarto título mundial de la mano de jugadores destacados como Dunga, Taffarel, Branco, Romário y Bebeto. Y el subcampeonato conseguido en el Mundial de Rusia 2018. En la Eurocopa, ha conseguido también notables actuaciones, alcanzando los cuartos de final del torneo en dos ocasiones de las cinco en las que se ha clasificado para el torneo. El futbolista internacional inglés mantuvo relaciones sexuales con Thompson, al menos en siete ocasiones durante cuatro meses durante el embarazo de su esposa, Coleen McLoughlin. El 28 de febrero de 2015, marcó un doblete ante el Sunderland, convirtiéndose así en el primer futbolista en anotar más de diez goles en once temporadas consecutivas. Su debut oficial con la camiseta del cuadro estadounidense se produjo el 14 de julio en la victoria por 3:1 ante el Vancouver Whitecaps. El 17 de septiembre, marcó dos goles en la victoria por 4:2 sobre el Bayer 04 Leverkusen en la Liga de Campeones, marcando su gol número 200 con la camiseta de los «red devils». El gol de Rooney fue su 249ª en 543 partidos con el Manchester, alcanzando el hito en 215 partidos y cuatro temporadas menos que Charlton.
Rooney ingresó al minuto 59 en lugar de Darren Mattocks, y dio una asistencia a Paul Arriola. Rooney ingresó en el minuto 90 para recibir el trofeo. El primer gol de Wayne en la temporada 2020-21 llegó en el cuarto partido, ya que su lanzamiento de tiro libre en el minuto 87 marcó la diferencia en la victoria por 1:0 a domicilio ante el Norwich City. El 27 de junio marcó desde su propio campo por tercera vez en su carrera, con un gol de 10 metros por detrás de la línea de medio campo que superó al portero del Orlando City, Brian Rowe. Esta vez no logró evitar el descenso a la League One a falta de tres jornadas de la conclusión del campeonato, viéndose afectados por la sanción de 21 puntos que recibieron debido a los problemas económicos del club. «England League Cup 2002/03» (en inglés). «UEFA Champions League 2004-05» (en inglés). «Man City 1-0 Man Utd» (en inglés). «Wayne Rooney breaks Sir Bobby Charlton’s Man United scoring record». «Arsenal 1:2 Man Utd» (en inglés). «World Cup Final Tournaments 1930-2014 – Total Rankings» (en inglés). Wayne llegó a Sudáfrica con una gran expectativa debido a la gran temporada que tuvo con su club, sin embargo, el juego poco convincente de su selección hizo que se clasificaran con muchas dificultades en el grupo C, y terminaran siendo eliminados por la selección de Alemania en los octavos de final.