También puso fin a la racha de Federer de cinco títulos consecutivos en Wimbledon y 65 victorias consecutivas en canchas de césped, impidiéndole lograr un sexto título consecutivo en el césped londinense, Björn Borg había sido el único hasta la fecha en quedar a 1 partido de ganar 6 Wimbledon seguidos, curiosamente fue John McEnroe, zurdo de 22 años y segundo en el Ranking ATP en ese entonces (igual que Nadal ahora y con la misma edad también irónicamente) quien se lo impidió en 1981. Una vez concluido el torneo, Nadal quedó solo a 545 puntos de Federer en el Ranking ATP, lo más cerca que ha estado del número 1 hasta el momento, superando la barrera de los 6000 puntos por primera vez en su carrera al llegar a 6055 (muy cerca de los 6600 pts de Federer). En ese sentido, Brasil fue la primera en haber repetido ese honor en tres, cuatro y cinco oportunidades, siendo hasta el momento la máxima selección galardonada. Con esta victoria Nadal logró ganar los últimos cinco torneos en los que compitió y llegó a una racha de 29 partidos sin conocer la derrota. 21.ª victorias consecutivas en individuales, contra una sola derrota y su tercera victoria en dobles.
En cuartos enfrenta al ecuatoriano y ex top-ten Nicolás Lapentti, con la derrota de Federer en tercera ronda, Nadal quedaba nada más que un solo triunfo de destronarlo y con 3 posibilidades: si salía campeón del torneo, se convierte en el nuevo número 1 la próxima semana, si llega a la final y pierde desde el 11 de agosto y si solo vence a Lapentti, lars7 desde el 18 de agosto. Es importante recordar que la lesión que impidió a Neymar continuar disputando el mundial fue producto del encuentro, así como este fue el inmediatamente anterior a la humillante derrota frente a Alemania (7-1). También los duelos entre colombianos y brasileños fue marcado por una tragedia del club brasileño Chapecoense quien iba a disputar la final de la Copa Sudamericana 2016 con Atlético Nacional en Medellín el accidente ocurrió en territorio colombiano cerca al municipio de La Unión llegando a Medellín, perdiendo la vida casi la totalidad de los jugadores del club junto con periodistas y la tripulación del Vuelo 2933 de LaMia ocurrida el 28 de noviembre del 2016, tras este suceso también se ha vuelto un tema de hermandad entre ambos países.
Tras una semana de descanso, el 23 de junio empezó el tercer Grand Slam del año: Wimbledon al que Nadal llegaba como uno de los favoritos, solo detrás del 5 veces campeón defensor Roger Federer: como era obvio quedó en la parte baja del cuadro compartiendo cuadro contra Andy Roddick, Nikolái Davydenko y Andy Murray como sus rivales más peligrosos camino a la final. 1 por primera vez, para esto Rafa debía lograr una buena actuación en el territorio estadounidense (si salía campeón podía ser el número uno del mundo la próxima semana incluso). En semifinales se enfrenta al campeón defensor, el especialista en esta superficie y norteamericano Andy Roddick (quien además había campeonado 4 veces aquí), venciéndolo con dificultades por 7-5 y 6-4 en 1 hora y 27 minutos clasificándose para la tercera final en césped de su carrera, la primera fuera de Wimbledon. En cuartos de final se enfrentó a un tercer estadounidense durante su participación en el torneo, Mardy Fish (n.º 35 del mundo), al que ganó por 3-6, 6-1, 6-4 y 6-2 en 2 horas y 38 minutos en un partido que terminó pasado las 2 AM en Estados Unidos, para así acceder a las semifinales en Flushing Meadows por primera vez en su carrera, pero sin jugar un tenis brillante, además logró llegar a las semifinales de los 4 Grand Slam en un mismo año por primera vez en su carrera y a la vez, con 22 años y 2 meses se convirtió en el tenista más joven en llegar a semifinales en cada Grand Slam en una misma temporada, ese mismo día el miércoles 3 de septiembre (aunque ya era jueves 4 en USA) se le fue otorgado el Premio Príncipe de Asturias de los Deportes.